- Evoluční parazitologie (Martin Kolísko)
- Molekulární parazitologie (Alena Panicucci Zíková)
- Veterinární a lékařská parazitologie (Martin Kváč)
- Přenašeči onemocnění a patogeny (Jan Perner)
- Parazitologie vodních organismů (Ivan Fiala)
- Podpůrná pracoviště
- Vědecký časopis Folia Parasitologica
- Laboratoř elektronové mikroskopie