RNDr. Petr Kopáček, CSc.

Funkce: Vědecký pracovník - Laboratoř molekulární biologie klíšťat

Kontaktní údaje

Telefon: +420 387775148
E-mail: kopajz@paru.cas.cz
Místnost: 336

Odborný životopis

Narozen
14.4.1958 v Českých Budějovicích
ORCID Id: 0000-0003-2412-5724

Vzdělání
1982– RNDr. - fyzikální chemie, Přírodovědecká UK Praha
1988– postgraduální studium analytické izotachoforézy, UK Bratislava
1993– CSc. – biochemie, Ústav organické chemie a biochemie AVČR, Praha

Zaměstnání a dosavadní praxe
1982–1983: Parazitologický ústav ČSAV v Č. Budějovicích, studijní pobyt – isoenzymy parazitických protozoí
1983–1985: Entomologický ústav ČSAV v Č. Budějovicích, vědecký asistent- fyziologie čichu u hmyzu
1985–1993: Laboratoř analytické chemie, BC ČSAV v Č. Bu. – vědecký asistent – analýza proteinů, elektroforetické a chromatografické techniky
1993–1995: Laboratoř analytické chemie, Entomologický ústav AVČR v Č. Budějovicích, vědecký pracovník – imunitní systém hmyzu
1995–1996: Galena a.s., Výzkumná jednotka v Č. Budějovicích – proteiny vázající farmaka
1996–dosud: Parazitologický ústav AVČR Č. Budějovice a Biologická fakulta JU, České Budějovice – vědecký pracovník – imunitní systém klíšťat

Zahraniční stáže a pobyty
Říjen–listopad 1989: Stáž na TU Mnichov (Prof. B. Radola, Prof A. Görg) zaměřená na izoelektrickou fokusaci a dvourozměrnou elektroforézu
Říjen 1991–listopad 1992: Stáž na Univerzitě Uppsala, Ústav fyziologické botaniky (Prof. K. Söderhäll) studium proteinů račí plazmy
Květen 1994–červen 1995: Stipendium nadace Alexander von Humboldta, Zoologický ústav Svobodné univerzity v Berlíně (Prof. P. Götz and Prof. M. Schweiger) - studium hmyzího profenoloxidázového systému
Duben 1997–červen 1997: Stáž na Univerzitě Arizona, Tucson, USA (Prof. John H. Law) - problematika klíštěcích feritinů
Červen 2000: Kurz- Biology of Disease Vectors Course, Státní univerzita Colorado, Fort Collins, USA
Červen 2000 – srpen 2000: Letní laboratorní pobyt v Mořském Biologickém Centru, Woods Hole, MA, USA (Prof. Peter B. Armstrong) - problematika receptoru pro alpha-2-makroglobulin z ostrorepa
Říjen–listopad 2003: Kurz EMBO/ICTTD "Integrated Molecular Diagnostics for Tick-borne Pathogens Using RLB Hybridization and Microarray Based Biochips", Univerzita Pretorie, Jihoafrická republika
Listopad 2006 – Studijní pobyt, Universita Sao Paulo a Federální universita Rio de Janeiro, Brazílie

Řešené projekty
a) hlavní řešitel
1997–1999 – Immune system of a tick: Identification and characterization of proteins involved in clotting and melanization of tick hemolymph (A6022701, Grantová agentura AVČR)
2000–2002 –Humoral factors and cellular events involved in pathogen transmission by ticks (206/00/266 Grantová agentura ČR)
2003–2005 – Immune reactions within the gut of the soft tick Ornithodoros moubata (A6022307 Grantová agentura AVČR)
2005–2008 – The role of α2-macroglobulin in pathogen transmission by the tick Ixodes ricinus (IAA600220603, Grantová agentura AVČR).
2005–2008 – Peptidases in the gut of the hard tick Ixodes ricinus: characterization and potential for vector-control (206/060/865, Grantová agentura ČR)
2009–2012 – The digestive system of ticks – the target for rational development of vaccine against tick and tick-borne pathogens (IAA600960910 Grantová agentura AVČR)
2010–2012 – Functional genomics of the complement-like molecules in the tick Ixodes ricinus (P506/10/2136 Grantová agentura ČR)
2013–2017 – The role of hemoglobin in tick metabolism and pathogen transmission (13-11043S, Grantová agentura ČR) (cena GAČR 2018 - see below)
2018–2020 Nutritional factors essential for tick development and reproduction (18-01832S, Grantová agentura ČR)
2020–2022 – The role of Toll pathway in the regulation of tick immune response against tick-transmitted pathogens (20-05736S, Grantová agentura ČR)
b) spoluřešitel
2010–2013 – Structural proteomics of tick proteolytic systems (P207/10/2183 Grantová agentura ČR)
2011–2014 – Development of a vaccine protecting against transmission of tick-borne diseases based on ferritin 2 for veterinary and human application (FR-TI/3-156, MŠMT ČR)
2019–2022 – Midgut microbial ecology, epithelial immunity, and vector competence of Ixodes ricinus and Amblyomma americanum (19-04301S, Grantová agentura ČR)

Publikační činnost (do listopadu 2020)
Publikace v recenzovaných časopisech s impaktním faktorem – 75
Kapitoly v knihách – 4
Patenty – 3
Počet citací bez autocitací ~ 2350
Hirsch index – 33

Pedagogická činnost
Školitel 6 a školitel-soecialista 2 obhájených PhD. dizertací a cca 25 pregraduálních diplomocých prací (Bc., Mgr.)
Září 2019 – vyučující dvoutýdenní kurz “Escola de Altos Estudos” (High Studies School Program granted by Brazilian Federal Agency for Post-graduate Educatio, CAPES) na Federální univerzitě Rio de Janeiro a Federální univerzitě Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Brazílie.

Ostatní aktivity
Od roku 2012 - Člen ediční rady časopisu Developmental and Comparative Immunology (Elsevier)
2017-2021 – GAČR, člen hodnotícího panelu 502

Ocenění
2018 – Cena předsedkyně GAČR za nejúspěšnější projekt v sekci Biologických a zamědělských věd
(13-11043S, “Úloha hemoglobinu v metabolismu klíšťat a přenosu patogenů”)

Publikace

Celkem nalezeno: 94 záznamů
Garcia Guizzo M., Frantová H., Lu S., Kozelková T., Číhalová K., Dyčka F., Hrbatová A., Tonk-Rügen M., Perner J., Ribeiro J., Fogaca A.C., Žůrek L., Kopáček P. (2024) The immune factors involved in the rapid clearance of bacteria from the midgut of the tick Ixodes ricinus Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 14 : 1450353. DOI: 10.3389/fcimb.2024.1450353
Jalovecká M., Malandrin L., Urbanová V., Mahmood S., Šnebergerová P., Pekľanská M., Pavlasová V., Šíma R., Kopáček P., Perner J., Hajdušek O. (2024) Activation of the tick Toll pathway to control infection of Ixodes ricinus by the apicomplexan parasite Babesia microti PLoS Pathogens 20 : e1012743. DOI: 10.1371/journal.ppat.1012743
Matoušková Z., Orsághová K., Srb P., Pytelková J., Kukačka Z., Buša M., Hajdušek O., Šíma R., Fábry M., Novák P., Horn M., Kopáček P., Mareš M. (2024) An unusual two-domain thyropin from tick saliva: NMR solution structure and highly selective inhibition of cysteine cathepsins modulated by glycosaminoglycans International Journal of Molecular Sciences 25 : 2240. DOI: 10.3390/ijms25042240
Urbanová V., Lu S., Kalinová E., Martins L., Kozelková T., Dycka F., Ribeiro J., Hajdušek O., Perner J., Kopáček P. (2024) From the fat body to the hemolymph: Profiling tick immune and storage proteins through transcriptomics and proteomics Insect Biochemistry and Molecular Biology 5 : 104072. DOI: 10.1016/j.ibmb.2024.104072
Garcia Guizzo M., Hatalová T., Frantová H., Zurek L., Kopáček P., Perner J. (2023) Ixodes ricinus ticks have a functional association with Midichloria mitochondrii Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 12 : 1081666. DOI: 10.3389/fcimb.2022.1081666
Hajdušek O., Kopáček P., Perner J. (2023) Experimental platforms for functional genomics in ticks Current Opinion in Insect Science 59 : 101102. DOI: 10.1016/j.cois.2023.101102
Hatalová T., Erhart J., Kopáček P., Perner J. (2023) On the haem auxotrophy of the soft tick Ornithodoros moubata Ticks and Tick-borne Diseases 14 : 102170. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2023.102170
Kozelková T., Dyčka F., Lu S., Urbanová V., Frantová H., Sojka D., Šíma R., Horn M., Perner J., Kopáček P. (2023) Insight into the dynamics of the Ixodes ricinus nymphal midgut proteome Molecular and Cellular Proteomics 22 : 100663. DOI: 10.1016/j.mcpro.2023.100663
Pavanelo D.B., Piloto-Sardiñas E., Maitre A., Abuin‐Denis L., Kopáček P., Cabezas-Cruz A., Fogaca A.C. (2023) Arthropod microbiota: shaping pathogen establishment and enabling control Frontiers in Arachnid Science 2 : 1297733. DOI: 10.3389/frchs.2023.1297733
Ribeiro J., Hartmann D., Bartošová-Sojková P., Debat H., Moos M., Fara J., Šimek P., Palus M., Kučera M., Hajdušek O., Sojka D., Kopáček P., Perner J. (2023) Blood-feeding adaptations and virome assessment of the poultry red mite Dermanyssus gallinae guided by RNA-seq Communications Biology 6 : 517. DOI: 10.1038/s42003-023-04907-x
Rodríguez-Mallon A., Encinosa Guzmán P.E., Bello Y., Domingos A., Antunes S., Kopáček P., Santos A.S., Velez R., Perner J., Ledesma Bravo F.L., Frantová H., Erhart J., Rodríguez R., Fuentes A., Diago D., Joglar M., Méndez L., Estrada M.P. (2023) Efficacy of the Vaccine Candidate Based on the P0 Peptide against Dermacentor nitens and Ixodes ricinus Ticks Pathogens 12 : 1365. DOI: 10.3390/pathogens12111365
Fiorotti J., Urbanová V., Gôlo P.S., Bittencourt V., Kopáček P. (2022) The role of complement in the tick cellular immune defense against the entomopathogenic fungus Metarhizium robertsii Developmental and Comparative Immunology 126 : 104234. DOI: 10.1016/j.dci.2021.104234
Garcia Guizzo M., Dolezelikova K., Neupane S., Frantová H., Hrbatová A., Pafčo B., Fiorotti J., Kopáček P., Zurek L. (2022) Characterization and manipulation of the bacterial community in the midgut of Ixodes ricinus Parasites & Vectors 15 : 248. DOI: 10.1186/s13071-022-05362
Perner J., Hajdušek O., Kopáček P. (2022) Independent somatic distribution of heme and iron in ticks Current Opinion in Insect Science 51 : 100916. DOI: 10.1016/j.cois.2022.100916
Perner J., Kučera M., Frantová H., Urbanová V., Kopáček P., Šíma R. (2022) Lyme disease transmission by severely impaired ticks Open Biology 12 : 210244. DOI: 10.1098/rsob.210244
Urbanová V., Kalinová Kalinová, Kopáček P., Šíma R. (2022) Experimental infection of mice and ticks with the human isolate of Anaplasma phagocytophilum NY-18 Pathogens 11 : 820. DOI: 10.3390/pathogens1107082
Fogaca A.C., Sousa G., Pavanelo D.B., Esteves E., Martins L., Urbanová V., Kopáček P., Daffre S. (2021) Tick Immune System: What Is Known, the Interconnections, the Gaps, and the Challenges Frontiers in Immunology 12 : 628054. DOI: 10.3389/fimmu.2021.628054
Kopáček P., Šíma R., Perner J. (2021) An mRNA-based anti-tick vaccine catches ticks red-handed Science Translational Medicine 13eabm2504 : eabm2504. DOI: 10.1126/scitranslmed.abm2504
Kozelková T., Doležel D., Grunclová L., Kučera M., Perner J., Kopáček P. (2021) Functional characterization of the insulin signaling pathway in the hard tick Ixodes ricinus Ticks and Tick-borne Diseases 12 : 101694. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2021.101694
Mahmood S., Šíma R., Urbanová V., Trentelman J.J., Krezdorn N., Winter P., Kopáček P., Hovius J., Hajdušek O. (2021) Identification of Tick Ixodes ricinus Midgut Genes Differentially Expressed During the Transmission of Borrelia afzelii Spirochetes Using a Transcriptomic Approach Frontiers in Immunology 11 : 612412. DOI: 10.3389/fimmu.2020.612412

Více publikací

RNDr. Petr Kopáček, CSc.

KONTAKT

NAJÍT PRACOVNÍKA