Oddělení
Evoluční parazitologie (Martin Kolísko)
- Laboratoř evoluční protistologie (Miroslav Oborník)
- Pracovní skupina (Aleš Horák)
- Pracovní skupina (Ansgar Gruber)
- Pracovní skupina (Miroslav Oborník)
- Laboratoř genomiky a diverzity protist (Martin Kolísko)
- Pracovní skupina (Martin Kolísko)
- Pracovní skupina (Elisabeth Christine Hehenberger)
- Laboratoř molekulární ekologie a evoluce (Jan Štefka)
Molekulární parazitologie (Alena Panicucci Zíková)
- Laboratoř evoluce makromolekulárních komplexů (Ondřej Gahura)
- Laboratoř funkční biologie protist (Alena Panicucci Zíková)
- Laboratoř molekulární biologie prvoků (Julius Lukeš)
- Pracovní skupina (Hassan Hashimi)
- Laboratoř RNA biologie prvoků (Zdeněk Paris)
Veterinární a lékařská parazitologie (Martin Kváč)
- Laboratoř parazitární terapie (Kateřina Jirků)
- Laboratoř veterinární a medicínské protistologie (Martin Kváč)
Přenašeči onemocnění a patogeny (Jan Perner)
- Laboratoř arbovirologie (Martin Palus)
- Laboratoř molekulární biologie a fyziologie komárů (Marcela Nouzová)
- Laboratoř molekulární biologie klíšťat (Jan Perner)
- Pracovní skupina (Daniel Sojka)
- Laboratoř molekulární ekologie vektorů a patogenů (Ryan O.M. Rego)
Parazitologie vodních organismů (Ivan Fiala)
- Laboratoř funkční helmintologie (Ivona Mladineo)
- Laboratoř helmintologie (Tomáš Scholz)
- Laboratoř rybí imunologie (Tomáš Korytář)
- Laboratoř rybí protistologie (Ivan Fiala)
- Pracovní skupina (Ivan Fiala)
- Pracovní skupina (Pavla Sojková)
Laboratoř elektronové mikroskopie (Marie Vancová)
Vědecký časopis Folia Parasitologica
